Ubiquigent通過調節和利用泛素系統來支持并支持針對蛋白質降解的藥物發現。

我們的化學和生物學平臺使我們能夠設計和開發新型化合物，作為戰略合作伙伴關系的一部分。同時，我們還提供對我們平臺和功能的訪問，以評估合作伙伴的化合物。

Ubiquigent –您在泛素化和蛋白質降解藥物發現方面的專業合作伙伴

在Ubiquigent，我們運用了遍在蛋白系統的專業知識來開發一套全面的檢測方法，以支持您的藥物發現計劃。因此，無論您是對識別或表征去泛素化酶（DUB）酶抑制劑或泛素連接酶的調節劑感興趣，還是希望利用泛素蛋白酶體系統（UPS）來觸發蛋白質的降解-包括跨越先前的“不可負擔的”靶標， –通過PROTAC或分子膠類型方法，我們擁有知識，化驗方法和能力來支持和推進您的藥物發現計劃的每個步驟。

泛素化在各種細胞過程中的中心作用使負責泛素化和去泛素化的酶成為解決一系列人類疾病的具吸引力的藥物靶標。自從諾貝爾獎因發現“泛素介導的蛋白質降解”和獲得蛋白酶體抑制劑的臨床批準而獲得諾貝爾獎以來，已有十多年的歷史，人們越來越有興趣利用泛素化機制的其他成分作為治療靶標，例如DUB。

選擇性DUB抑制劑的開發受到以下方面的限制：對DUB生物學的了解不足，難以建立適用于化合物篩選的可靠的生化分析方法，用于評估DUB活性或抑制作用的細胞和體內模型的局限性以及各種小分子的多效性DUB抑制劑（Harrigan et al。，2017）。在過去的十年中，泛用型科學家專注于構建一套生化和細胞分析方法，以鑒定和表征篩選結果，消除假陽性，確認細胞靶標參與以及探索分子的作用機理，以期為客戶提供支持藥物發現計劃。

通過我們的學術合作伙伴網絡，在藥物發現方面的集體經驗以及在遍在蛋白系統測定和藥物化學方面的廣泛深入的經驗，我們的科學家可以補充您針對疾病的專業知識，以幫助您確定真正的候選藥物。

向下滾動以探索我們的藥物發現篩選平臺如何應用于：

• 目標識別和確認
• DUB抑制劑的鑒定和表征
• 目標參與和細胞選擇性分析
• 行動機制研究
• PROTAC和分子膠
• E3連接酶

目標識別和確認

我們的PROTEOME profiler ™和DUB profiler -Cell™多重串聯質譜支持平臺??是功能強大的補充方法，可支持目標識別和驗證目標。

可以通過PROTEOME profiler ™揭示疾病狀態或其他實驗刺激（例如細胞因子添加或應激條件）引起的蛋白質表達和體內穩態的變化 服務。由于檢查了細胞或組織的整個蛋白質組，因此這是一種*無偏的方法，可用于識別上調或下調的目標靶標，包括但不限于泛素途徑。該工作流程非常靈活，可為您選擇的細胞系提供檢查，此外，多路程序可直接比較多個條件。利用等基因系進行的后續實驗（其中候選DUB（或連接酶）被基因刪除）可以進一步證實這些靶標與疾病的相關性（以及相關的途徑調節），從而提供可靠的靶標驗證。

該DUB 探查 -細胞™  平臺，專注于細胞或組織中的活動的DUB。使用該測定法，我們可以研究與治療相關的細胞和組織中單個候選DUBs或整個活性“ DUBome”的活性，或者比較攜帶遺傳定義突變或經各種刺激治療的同基因細胞對之間的活性DUBome。與PROTEOME profiler ™平臺一樣，DUB profiler -Cell™  工作流程具有高度的靈活性，可以檢查您選擇的細胞系。

DUB抑制劑的鑒定和表征

Ubiquigent的DUB profiler ™服務已確立為*的平臺，可用于鑒定和表征新型DUB抑制劑，并且已被領導小組采用以支持其藥物發現計劃。使用DUB profiler ™ 體外平臺可從您的資料庫中快速揭示化學起點，或利用該服務來支持化合物優化的Q-SAR藥用化學循環，從而在我們廣泛的DUB面板中建立效價和選擇性。

我們服務的*賣點之一就是靈活性。我們的大多數客戶希望使用我們經過驗證的標準標準DUB profiler ™，但如果您需要根據自己的需要量身定制檢測方法，例如調整預孵育參數或篩選任意數量的檢測試劑，我們很樂意與您合作來自我們廣泛研究小組的DUB，其化合物濃度不限。我們還能夠使用相同的分析形式快速確定由初篩產生的任何目標化合物的IC ₅₀值。

我們很高興通過以下任何一種方法對您的化合物進行進一步分析：

• 在正交試驗中確認命中（例如DUB profiler -MALDI™）
• 確定化合物的可逆性，競爭性/非競爭性（包括但不限于使用DUB 加合物 ™分析）
• 消除假陽性氧化還原循環化合物（REDOX profiler ™）

目標參與和細胞選擇性分析

的DUB 探查 -細胞™測定允許您快速確認測試中相關的細胞環境化合物-DUB目標接合，并提供相對于蜂窩EC ₅₀相對于每DUB接合由復合值。因此，它是非常有互補DUB 探查 ™，它是對疾病的上下文高度相關的附加功能，因為你可以詢問您選擇的細胞系（例如，一個在其中看到一個相關的表型/功能/治療/ PD該化合物的效果）。

行動機制研究

我們的PROTEOME profiler ™服務中的候選化合物對疾病相關細胞的治療提供了有關候選化合物作用機理的寶貴信息。分析是*無偏見且在蛋白質組范圍內的。時程和劑量反應研究可以與無效的類似物或工具化合物一起有效地納入研究。使用PROTEOME profiler ™  確認細胞中的主要靶標，揭示完整的途徑和蛋白質組學改變，并識別潛在的生物標志物，以協助和加速臨床發展。

PROTAC和分子膠

靶向蛋白水解的嵌合體（PROTAC）或分子膠的使用是一種新的方式，可以“劫持”泛素-蛋白酶體系統，從而引發與疾病有關的特定靶蛋白的降解，否則這些蛋白可能是化學上難以治療的。PROTAC的關鍵特征之一是它們的選擇性。但是，例如PROTAC MZ1已經證明，關于選擇性的預測并不總是在細胞中得到證實。因此，任何有針對性的蛋白質降解藥物發現計劃的基本要素（使用PROTAC，分子膠或類似方法）都是能夠通過了解向下和潛在的向上調節來證明與疾病相關的細胞環境中的選擇性。細胞蛋白質組個體成員的數量。

PROTEOME profiler ™  是一項新服務，可報告響應任何細胞輸入而產生的相對蛋白質組豐度變化，并在測試條件范圍內提供相對定量。該平臺可用于確定單個 PROTAC /分子膠的選擇性（例如，作為MOA研究的一部分或對許可機會進行盡職調查），或為未來的開發確定不同的PROTAC /分子膠設計的優先級。

即將發布我們的PROTAC profiler ™ 體外 Q-SAR分析平臺。

E3連接酶

幾位客戶已與Ubiquigent接觸，以利用我們對泛素途徑的知識和化驗開發專業知識來開發新型的泛素系統靶標化驗，以支持其藥物發現計劃。一如既往，我們可以靈活地滿足客戶的要求；可以在Ubiquigent上針對客戶化合物庫篩選經過驗證的測定，或轉移至客戶實驗室。作為一個例子，已經將IDOL鑒定為阿爾茨海默氏病以及脂質穩態中LDL受體（LDLR）的調節和更新的重要目標。我們已經開發了HTS兼容的IDOL  分析方法，用于篩選化合物庫。

泛素系統

泛素級聯反應在細胞信號傳導中的關鍵作用，以及對這種途徑中靶標治療潛力的日益驗證，正在引起學術界和行業研究人員對該領域的興趣。Ubiquigent正在通過先進的藥物發現篩選平臺，  研究工具和  化學幫助這一道路，   這使研究人員能夠加深對泛素的基本和潛在生物化學的了解，并加快該領域的藥物發現。

泛素化與磷酸化一樣，描述了可逆的翻譯后蛋白質修飾。泛素化或“泛素化”可控制蛋白質底物的命運（就其周轉率而言）或其信號傳導功能。這是一個過程，涉及一個稱為泛素的76個氨基酸小蛋白與底物蛋白（也可能是另一個泛素分子）中賴氨酸殘基的ε-氨基共價結合的過程。這導致底物的單泛素化或多泛素化。后者是泛素鏈附著于底物蛋白的位置。鏈的結構決定了蛋白質是否以蛋白酶體或溶酶體依賴性方式調節特定的信號級聯或降解。

泛素化途徑的酶在許多細胞過程中起關鍵作用，這些過程包括但不限于底物蛋白的靶向蛋白酶體依賴性降解。底物泛素化過程涉及三類酶。 活化酶（E1s），  結合酶（E2s）  和  連接酶（E3s）。底物蛋白的泛素化取決于這三種酶的順序作用。在依賴于ATP的一步中，E1酶與泛素形成硫酯鍵，然后在E2酶上轉移至活性位點半胱氨酸的巰基，形成泛素-硫酯中間體。然后，E3充當銜接子，以結合底物蛋白和被泛素“加載”的E2。E3促進泛素和底物蛋白之間的異肽鍵形成。

盡管仍然涉及翻譯后修飾，盡管涉及功能蛋白而非功能基團，但泛素化比磷酸化復雜得多。這主要是由于泛素形成各種不同連接類型和復雜性的聚泛素鏈的能力，而且還因為存在與泛素類似的 進一步相關 （Ubl）蛋白（包括SUMO，NEDD8，ISG15和FAT10），盡管遵循類似的特定酶級聯反應，但對于Ubl修飾的目標底物可能會產生不同的結果。在進一步的系統復雜性水平上，E3連接酶或底物的修飾可能會改變其修飾底物或修飾自身的能力。例如在E3連接酶的情況下通過NEDDylation（NEDD8是另一個Ubl），或者在E3連接酶和底物的情況下通過磷酸化。

PROTAC和分子膠

泛素蛋白酶體系統（UPS）是細胞控制受控蛋白質更新的主要途徑，它由一系列將泛素鏈綴合至目標蛋白質的酶（E1活化酶，E2綴合酶和E3連接酶）組成。多泛素化-以及一系列使泛素鏈解偶聯的酶（去泛素化酶； DUB）- 詳情請參見此處 。通過UPS與蛋白質偶聯的某些類型的泛素鏈可以指導該蛋白質被細胞蛋白酶體復合物降解。

蛋白水解靶向嵌合體（PROTAC）和分子膠為小分子靶向降解目標蛋白質（POI）提供了一種方法。一種被描述為可以解決“非藥物”蛋白質組的方法。PROTAC和相關的分子膠粘分子劫持UPS，以實現POI的“按需”降解。

PROTAC是一種異雙功能分子，由與待降解的POI結合的配體和與E3連接酶或E3連接酶底物結合適配器結合的配體組成。這兩個元件通過連接分子連接。POI與E3連接酶復合物結合形成三元復合物后，如果POI相對于E3連接酶復合物適當定位，則POI可以被多泛素化。然后，POI被蛋白酶體復合物降解。由于PROTAC可以循環使用以重復此過程，因此PROTAC具有催化作用機制（MOA），因此是“事件驅動”的。

分子膠是與PROTAC相關的分子，對E3連接酶或POI的結合親和力低，但增強了這種蛋白質間相互作用，使POI與E3連接酶結合并隨后發生多泛素化和POI降解。像PROTAC一樣，分子膠顯示出事件驅動的催化MOA。

人類DUB超級家族

下面介紹的是一組系統進化樹，它們代表通過比較酶的去泛素化催化結構域的序列同源性而構建的去結合酶（DCE）家族。根據域（CDD，HHpred，Pfam和SMART）和結構（PDB）數據庫的預測，表明了進一步的酶結構。經英國利物浦大學轉化醫學研究所和整合生物學研究所的Michael Clague教授和SylvieUrbé教授許可，展示了這棵樹和傳說。

治療區域和泛素系統

隨著細胞信號通路和網絡的揭示，調節細胞功能的蛋白質修飾的多樣性和復雜性不斷增長。泛素級聯在細胞信號傳導和蛋白質穩態中發揮的關鍵作用，以及在該途徑中對靶標治療潛力的越來越高的驗證，正在促使人們對以泛素系統為靶標的藥物發現產生興趣。

在本節中，我們試圖根據它們與關鍵治療領域的相關性，開始將泛素系統蛋白組裝成四類。這并非是詳盡無遺的清單，而是重點介紹了各種治療領域中的一些新工作，并且增加了各種泛素系統蛋白的概念的重要性，這些蛋白是潛在的藥物化學和藥物治療新靶標。

腫瘤科

心血管，炎癥和代謝

神經和肌肉骨骼

胃腸，肝和腎

心血管，炎癥和代謝

心臟動態平衡需要有效的蛋白質更新，因此蛋白酶體功能受損越來越多地與心臟病有關。已經確定了特定的泛素蛋白酶體和溶酶體降解以及心血管生物學，炎性疾病和代謝性疾病的潛在非降解機制，此外，許多此類細胞途徑已被提議為臨床相關靶標。例如在循環低密度脂蛋白的調節中。

下面我們列出了一些目標和疾病的關聯，重點介紹了各種治療領域的新工作。遍在蛋白系統中還有其他目標可能會被添加到此列表中，以及已經引用的目標物的進一步治療應用–為什么不讓我們知道您已經看到或正在研究的關鍵遍在蛋白系統治療學協會，并幫助我們建立這一目標資源。在這里提交您的建議。

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在心血管組織 ^71中表達的靶標

造血系統
的DUB：A20，  AMSH-LP，CYLD，EIF3H，OTUD5，PRPF8，USP3，USP4，USP7，USP8，USP9Y，USP15，USP20，USP25，USP28，USP33，USP34，USP36，USP39，USPL1 
E3連接酶：CBL，三重奏

心臟
的DUB：OTUB1，OTUD6A，USP13
E3連接酶：  CUL5 / Rnf7，DCNL1，  IDOL，癢，MURF1

造血系統中泛素相關的靶點  ⁷¹

↓–下調，↑–過度表達，[] –變異

免疫調節
DUB：A20  ⁵⁴，塞尚  ⁶⁴，OTUD5  ⁵²，OTULIN  ⁵⁵，USP4  ³¹，USP20  ⁴¹
E3里加斯：IPAH9.8  ⁶⁹，ITCH  ⁶
泛素結合蛋白：[ NEMO ] ⁷⁹

類風濕關節炎
E3連接酶：Cul1 / Rbx1  ¹⁴

脂質穩態
的DUB：USP8  ⁵⁹
E3連接酶：IDOL  ^1，2，59

心肌病
DUB：USP3，BRCC3 
E3連接酶：MURF1  ²⁵

白血病
DUB：[ A20 ]  ⁵⁵，BAP1  ⁶¹，[BRCC3]，↓ USP1，↑USP11，↑USP13，↑USP46 
E3里加斯：TRIAD  ²³，[ CBL ] ^75，76，  Cul5 / Rnf7  ¹⁰

造血系統癌癥
DUB：[ USP9x ]

腎小球腎炎
DUB：↑  OTUB1  ⁵¹

骨髓瘤
DUB：USP7 ³³
E3連接酶：[ CBL ] ⁷⁴
蛋白酶體（蛋白酶催化位點）^77，78

↓–下調，↑過表達，[] –變異

胃腸，肝和腎

在腸道，肝臟和腎臟中發現的各種細胞類型中，很明顯普遍需要適當控制蛋白質穩態。這些組織中發生的病理學不僅與泛素級聯反應而且與一般細胞信號轉導方面都越來越緊密地聯系在一起。

這并不是要詳盡列出目標和疾病的關聯，而是要重點介紹各種治療領域的新工作。遍在蛋白系統中還有其他目標可能會被添加到此列表中，以及已經引用的目標物的進一步治療應用–為什么不讓我們知道您已經看到或正在研究的關鍵遍在蛋白系統治療學協會，并幫助我們建立這一目標資源。在這里提交您的建議。

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組織類型⁷¹表達的泛素系統靶標 

消化系統
DUB：  AMSH-LP，BRCC3，MPND，USP12，YOD1

肝臟和膽道系統
DUB：塞尚，MPND，OTUB2，USP18，USP26，USP29，USP30，USP31，USP35，USP40，USP43 
E3里加斯：  Cul1 / Rbx1，Cul1 / Skp1 / Rbx1，IDOL，ITCH，RNF8

腎臟系統
DUBs：OTUD3，USP2，USP21，USP45 
E3里加斯：Cul1 / Rbx1，  Cul1 / Skp1 / Rbx1，DCNL1，ITCH

泛素系統靶向胃腸道，肝臟和腎臟疾病  ⁷¹

↓–下調，↑–過度表達，[] –變異

食道癌
DUB：↑ USP17， ↓ USP46

胃癌
DUBs：↓ AMSH，↑ USP1
E3連接酶：  Cul1 / Skp1 / Rbx1  ⁶⁸

大腸癌
DUB：[ A20 ]，[ Ataxin-3L ]，[塞尚]，[塞尚2]，[USP17]，[MYSM1]，[ OTUD3 ]，[OTUD4]，[ USP2 ]，[USP3]，[ USP4 ] ，[ USP5 ]，[ USP6 ]，[ USP7 ]，[ USP8 ]，[ USP9x ]，[USP9Y]，[USP11]，[USP13]，[USP16]，[USP19]，[ USP21 ]，[ USP25 ]，[ [USP26]，[ USP28 ]，[USP29]，[USP31]，[USP32]，[USP33]，[ USP34 ]，[USP36]，[USP42]，[USP44]，[USP45]，[USP47]，[USP48] ，↓USP49，[USP51]，[USP54]，[USPL1]，[VCPIP1]

大腸癌
DUBs：↑ AMSH-LP，↓塞尚，↑EIF3H，↓MPND，↓ JOSD1，↓ OTUD1，↑ OTUD6B，↑OTUB2，↓ UCHL1，↑ UCHL1  ⁴⁷，↑ UCHL3，↓ USP2，USP9x  ³⁵，↑ USP14  ³⁷，↑USP17，↑USP22，↓USP53，↑USPL1 
E3連接酶：  RNF8  ⁷⁰

肝癌
DUB：[PRPF8]，↑USP14  ³⁶，[ USP25 ]，[USP38]，[USP40] 
E3連接酶：SMURF1  ²⁰

尿路癌
DUBs：[ USP2 ]，[ USP4 ]，[ USP5 ]，[USP26]，[USP48]，[VCPIP1]

腎癌
DUBs：↑ AMSH-LP，[BAP1]  ⁶⁰，↓ UCHL1，↓ USP2，↓ USP5，↑ USP14，↑USP34，↓USP46 
E3里加斯：  Cul3 / Rbx1  ¹³，Cul5 / Rnf7  ¹¹

膀胱癌
DUB：↑ OTUB1，↑ USP4，USP2  ²⁹
E3連接酶：Cul3 / Rbx1  ¹²

腎小球腎炎
DUB：↑ OTUB1  ⁵¹

糖尿病
DUB：OTUB2  ⁵⁰

↓–下調，↑過表達，[] –變異

神經和肌肉骨骼

缺乏或失去對泛素和自噬信號傳導級聯的充分控制的原因已歸因于神經退行性疾病并與之相關。神經元在很大程度上依賴于這些系統的正常運行才能正常運行，從而使脆弱的神經元的功能紊亂可能導致蛋白質聚集，內質網應激增加和細胞死亡。肌肉更新的調節也與泛素系統的控制有關。

這并不是要詳盡列出目標和疾病的關聯，而是要重點介紹各種治療領域新工作。遍在蛋白系統中還有其他目標可能會被添加到此列表中，以及已經引用的目標物的進一步治療應用–為什么不讓我們知道您已經看到或正在研究的關鍵遍在蛋白系統治療學協會，并幫助我們建立這一目標資源。在這里提交您的建議。

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在CNS，PNS和肌肉組織中表達的泛素系統靶標  ⁷¹

腦
的DUB：共濟失調-3L，Cezanne2，MYSM1，OTUB1，TRABID，UCHL1，USP3，USP6，USP9X，USP11，USP14，USP21，USP22，USP26，USP29，USP32，USP33，USP42，USP46，USP51，USP54 
E3連接酶：  CUL1 / Rbx1，  Cul1 / Rbx1 / Skp1，Cul3 / Rbx1，Cul5 / Rnf7，DCNL1，CHIP，  IDOL，ITCH，RNF8，RNF11，ZNRF2  ⁸

脊髓
DUB：AMSH

骨骼肌
DUB：CSN5，EIF3F，OTUB2，OTUD1，USP2，USP13，USP19，USP38，USP39，USP49，USP54 
E3里加斯：  IDOL，  ITCH，CHIP，  Cul5 / Rnf7，MURF1

泛素系統靶向神經和肌肉疾病  ⁷¹

↓–下調，↑–過度表達，[] –變異

抑郁抑郁癥
：USP46

帕金森氏病
DUBs：UCHL1，USP25，USP40，Ataxin-3  ⁵³
E2共軛酶：Ube2A ⁸¹
E3天gas座：RNF11  ²¹，  Parkin  ²⁷

阿爾茨海默氏病
DUBs：USP14  ³⁸
E1激活酶：APP-BP1 / UBA3  ⁷³
E3里加斯：Cul1 / Rbx1  ¹⁵，  CHIP  ^3，5，Parkin  ²⁶

神經退行性疾病
DUBs：Ataxin-3，  UCHL1  ⁴⁶
E2共軛酶：Ube2A ⁸¹，Ube2H ⁸³，Ube2K ⁸⁵
E3天gas座：RNF11 ²²，DCNL1  ²⁴，CHIP  ⁴

與腦相關的癌癥
DUB：↓Cezanne2，↓ UCHL1，↑ USP1，↑USP3，[ USP5 ]  ³²，↓USP11，[ USP15 ]  ³⁹
E3 Ligases：CHIP  ⁷

肌肉骨骼疾病和萎縮
E1激活酶：[ Ube1 ] ⁷²
E2結合酶：  Ube2H ⁸³
E3里加斯：↑  MuRF1 ⁹⁰
DUBs：  Ataxin-3，  Ataxin-3L，USP14  ⁴⁰，USP19  ⁴⁰
UBP：[ Optineurin ] ⁸⁰

腫瘤科

不受控制的細胞分裂是腫瘤的標志，細胞分裂失調，細胞凋亡和對生長因子的反應突顯了這一點。腫瘤的微環境可能顯示出細胞代謝改變和蛋白酶體活性增加。細胞失調的許多方面以及在腫瘤學中進行治療性干預的機會都涉及泛素級聯反應的各個方面，例如癌基因的調控和腫瘤抑制因子的轉換。

這并不是要詳盡列出目標和疾病的關聯，而是要重點介紹各種治療領域的新工作。遍在蛋白系統中還有其他目標可能會被添加到此列表中，以及已經引用的目標物的進一步治療應用–為什么不讓我們知道您已經看到或正在研究的關鍵遍在蛋白系統治療學協會，并幫助我們建立這一目標資源。在這里提交您的建議。

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遍在蛋白系統與腫瘤相關的靶標  ⁷¹

↓–下調，↑–過度表達，[] –變異

乳腺癌
DUBs：↑塞尚  ⁶⁵，[CSN6]，[EIF3H]，↑ OTUB2，↓ USP2，↑ USP14，USP11  ^62，63，[ USP15 ]，↓USP16，↓USP22，↑USP22，↓USP24，
↑ USP28  ⁴³， ↑USP32，USP35  ⁶⁴，↓USP44，↓USP46，↓USP47，↓USP53 
E2共軛酶：Ube2Q1 ⁸⁶，Ube2Q2 ⁸⁷
E3里加斯：WWP1  ¹⁷，SMURF1  ¹⁸，SMURF2  ¹⁸

宮頸癌
DUBs：↑USP17，UCHL3  ⁴⁸
E2結合酶：Ube2S ⁸⁸
E3連接酶：↑ BIRC2  ⁹

卵巢癌
DUB：↑ USP2，↑ USP14，↓ USP15，[ USP15 ]，[USP34]，↑ USP36  ⁴⁴，OTU1  ⁴⁹

肺（NSCLC）
DUB：↑CSN5，↑ JOSD1，↓ OTUD1，↓ USP1  ²⁸，↑ USP4，  USP8  ⁵⁸，↑ USP9x，↑USP17，↓ USP25  ⁴²，↓USP53，↑ UCHL1
E2結合酶：Ube2C ⁸²，Ube2C ⁸²，Ube2T ⁸⁹
E3 Ligases：RNF8  ¹⁶

肺（SCLC）
DUB：↑ USP4，↓  USP4

淋巴瘤
DUB：↓ A20，↓ JOSD1，↓ OTUD1，↓USP22，↓ USP28，↓USP34，↓ USP36，↓USP53，↓USPL1，[PRPF8]，[ USP9x ]，↑BRCC3，↑USP31

黑色素瘤
DUB：[BAP1]，↑CSN5，USP8  ⁵⁷，↑USP10，↑USP11，↑USP22，↑USP48 
E3里加斯：Cul1 / Rbx1  ⁶⁷，Cul1 / Skp1 / Rbx1  ⁶⁷

皮膚癌
的DUB：[ 共濟失調蛋白-3L ]，[Cezanne2]，[ CYLD ]  ⁴⁵，[USP17]，[MYSM1]，[PRPF8]，[ USP2 ]，[ USP4 ]，[ USP5 ]，[ USP6 ]，[ USP7 ] ，[ USP8 ]，[ USP9x ]，[USP9Y]，[USP13]，[ USP19 ]，[ USP25 ]，[USP26]，[ USP28 ]，[USP29]，[USP31]，[USP32]，[USP34]，[ [ USP36 ]，[USP37]，[USP42]，[USP44]，[USP47]，[USP48]，↓USP49，[USP51]，[USPL1]，[VCPIP1]

前列腺癌
DUB：  USP2  ³⁰

骨髓瘤
DUB：USP7  ³³
E3連接酶：[ CBL ] ⁷⁴ 
蛋白酶體（蛋白酶催化位點）^77，78

胰腺癌
DUB：USP9x  ³⁴

腦癌
的DUB：↓Cezanne2，↓ UCHL1，↑ USP1，↑USP3，↓USP11，[ USP15 ] 
E3連接酶：CHIP  ⁷

食道癌
DUB：↑ USP17， ↓ USP46

胃癌
DUB：↓ AMSH，↑ USP1

大腸癌
DUB：[ A20 ]，[ Ataxin-3L ]，[塞尚]，[Cezanne2]，[USP17]，[MYSM1]，[ OTUD3 ]，[OTUD4]，[ USP2 ]，[USP3]，[ USP4 ] ，[ USP5 ]，[ USP6 ]，[ USP7 ]，[ USP8 ]，[ USP9x ]，[USP9Y]，[USP11]，[USP13]，[USP16]，[ USP19 ]，[ USP21 ]，[ USP25 ]，[ [USP26]，[ USP28 ]，[USP29]，[USP31]，[USP32]，[USP33]，[ USP34 ]，[USP36]，[USP42]，[USP44]，[USP45]，[USP47]，[USP48] ，↓USP49，[USP51]，[USP54]，[USPL1]，[VCPIP1]

大腸癌
DUBs：↑ AMSH-LP，↓塞尚，↑EIF3H，↓MPND，↓ JOSD1，↓OTUD1，↑ OTUD6B，↑ OTUB2，↓ UCHL1，↑ UCHL1  ⁴⁷，↑ UCHL3，↓ USP2，USP9x  ³⁵，↑ USP14  ³⁷，↑USP17，↑USP22，↓USP53，↑USPL1 
E3連接酶：  RNF8

肝癌
DUB：[PRPF8]，↑ USP14  ³⁶，[ USP25 ]，[USP38]，[USP40] 
E3連接酶：SMURF1  ²⁰

尿路癌
DUBs：[ USP2 ]，[ USP4 ]，[ USP5 ]，[USP26]，[USP48]，[VCPIP1]

腎癌
DUBs：↑  AMSH-LP，[BAP1]，↓ UCHL1，↓ USP2，↓ USP5，↑ USP14，↑USP34，↓USP46 
E3里加斯：Cul3 / Rbx1  ¹³，Cul5 / Rnf7  ¹¹

膀胱癌
DUB：↑ OTUB1，↑ USP4，USP2  ²⁹
E3連接酶：Cul3 / Rbx1  ¹²

白血病
DUB：[BRCC3]，↓ USP1，↑USP11，↑USP13，↑USP46 
E3里加斯：TRIAD  ²³，[ CBL ] ^75，76，  Cul5 / Rnf7  ¹⁰

造血系統癌癥
DUB：[ USP9x ]

↓–下調，↑過表達，[] –變異